日前,合成生物學(xué)領(lǐng)域的國際頂級學(xué)生科技賽事——國際基因工程機(jī)器大賽(InternationalGeneticallyEngineeredMachineCompetition,iGEM)2022全球總決賽結(jié)果揭曉。同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院2支代表隊(duì)伍,與來自41個(gè)國家和地區(qū)的346支代表隊(duì)同場競技,經(jīng)過激烈角逐,最終以優(yōu)異的成績脫穎而出,分別斬獲1枚金牌和1枚銅牌。同濟(jì)學(xué)子屢創(chuàng)佳績,在國際舞臺上盡顯同濟(jì)人的風(fēng)采。
國際基因工程機(jī)器大賽(iGEM)始于2003年,由美國麻省理工學(xué)院(MIT)主辦,是合成生物學(xué)領(lǐng)域的國際頂級學(xué)生科技賽事,已經(jīng)成功舉辦了16屆,今年共有來自全球各地的346支隊(duì)伍參賽。合成生物學(xué)是近年來生命科學(xué)領(lǐng)域的新興研究方向,其目標(biāo)是通過重組現(xiàn)有基因,構(gòu)建對生命科學(xué)研究或者生產(chǎn)生活實(shí)踐具有價(jià)值的生物系統(tǒng)。iGEM競賽以合成生物學(xué)為基礎(chǔ),更加關(guān)注設(shè)計(jì)生物系統(tǒng)對iGEM社區(qū)和社會的實(shí)際作用。
Tongji_China代表隊(duì)
(相關(guān)資料圖)
項(xiàng)目簡介:
菠蘿蛋白酶是一種植物蛋白酶,具有多種特性,包括抗癌活性、抗炎作用、抗菌作用、增強(qiáng)抗生素作用、保護(hù)皮膚、術(shù)后恢復(fù)等。它在醫(yī)療和食品領(lǐng)域有廣泛的應(yīng)用。盡管菠蘿蛋白酶具有很大的應(yīng)用潛力,但傳統(tǒng)的生產(chǎn)工藝存在效率低、來源不穩(wěn)定、酶活性低等問題?;谶@一點(diǎn),Tongji_China今年的參賽項(xiàng)目使用大腸桿菌來重組表達(dá)菠蘿蛋白酶,并通過定向進(jìn)化提高了酶活性和穩(wěn)定性。此外,隊(duì)員們還發(fā)現(xiàn)了菠蘿蛋白酶在飼料領(lǐng)域的巨大潛力,他們選擇枯草芽孢桿菌wb800菌株作為這一特定應(yīng)用場景的底盤,其表達(dá)的重組菠蘿蛋白酶能夠作為飼料添加劑加工處理粗飼料,可提升飼料中蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化率、提高動物抗病能力。
受今年上半年疫情的影響,Tongji_China的隊(duì)內(nèi)活動無法線下開展,面臨著巨大的挑戰(zhàn)。隊(duì)員們克服了重重困難,在前期以線上的方式做好了各類準(zhǔn)備工作的前提下,于9月份開始在濕實(shí)驗(yàn)的部分奮起直追,最終不負(fù)眾望,延續(xù)Tongji_China三年全金的傳統(tǒng),斬獲金獎(jiǎng)!
隊(duì)員名單:
生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院:文嘉穎、郭禎翔、葉璟怡、呂璟瑄
國豪書院(生物強(qiáng)基班):蔡婧嫻、趙珂瑤
化學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院:程匯文
醫(yī)學(xué)院:佟國盛
軟件學(xué)院:方儀
設(shè)計(jì)創(chuàng)意學(xué)院:高培中、楊彥斌
Tongji_Software代表隊(duì)
項(xiàng)目簡介:
基因編輯技術(shù)在合成生物學(xué)研究中是一種不可或缺的工具,但目前也存在脫靶效應(yīng)、非特異性結(jié)合等問題。研究發(fā)現(xiàn)anti-CRISPR蛋白可抑制脫靶效應(yīng)、提高安全性,它還能作為基因編輯調(diào)控的抑制劑,提供更多可選擇的工具來進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。anti-CRISPR基因可以編碼并通過載體體內(nèi)遞送或原位發(fā)揮作用,由于它們與CRISPR-Cas系統(tǒng)分開,因此可以根據(jù)Cas動態(tài)調(diào)控范圍,無需昂貴的配體、設(shè)備即可將anti-CRISPR蛋白整合到各種系統(tǒng)中。目前已發(fā)現(xiàn)許多抗CRISPR蛋白,如AcrIIA5、AcrIIC1和AcrVA1,可抑制其靶標(biāo)的多個(gè)同源物。這種廣譜活性無需重新設(shè)計(jì)每個(gè)Cas蛋白便可用于調(diào)節(jié)CRISPR-Cas系統(tǒng)的多種天然和工程變體。此外,JosephBondy-Denomy等研究人員已鑒定出多種靶點(diǎn)相同,但大小、抑制強(qiáng)度和作用機(jī)制等差異很大的anti-CRISPR蛋白,日后有望將其推廣到不同的實(shí)驗(yàn)場景。
因此,團(tuán)隊(duì)關(guān)注到這種蛋白,希望能通過尋找這些有助于基因編輯的蛋白來輔助合成生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。軟件設(shè)計(jì)的目的是提供一個(gè)可以搜索不斷擴(kuò)大的病毒基因組、宏基因組等數(shù)據(jù)庫的全新anti-CRISPR蛋白的工具,從而擴(kuò)展anti-CRISPR的多樣性,為合成生物學(xué)潛在基因編輯工具的挖掘提供一種簡單便捷的方式。
隊(duì)員名單:
生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院:張世越、鄭裕龍、李詩雨、周詩璇
軟件學(xué)院:張子涵、楊鑫、袁楓燁、陳晨
數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院:張佳妮
設(shè)計(jì)創(chuàng)意學(xué)院:李雪琛
同濟(jì)大學(xué)iGEM代表隊(duì)由生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、軟件學(xué)院、醫(yī)學(xué)院、設(shè)計(jì)創(chuàng)意學(xué)院、數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院、國豪書院和化學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院七個(gè)學(xué)院組隊(duì)。2022年疫情形勢復(fù)雜,同學(xué)們在老師的指導(dǎo)下,利用課外時(shí)間進(jìn)行了大量的文獻(xiàn)調(diào)研,反復(fù)研討最終確定了參賽選題并逐步推進(jìn)項(xiàng)目。為了能夠了解實(shí)際生產(chǎn)和理論研究的前沿,同學(xué)們在線上開展了對相關(guān)企業(yè)參訪,獲得第一手資料,同時(shí)還與其他高校iGEM參賽隊(duì)開展了廣泛的合作交流。此外,同學(xué)們還走進(jìn)中小學(xué)進(jìn)行科普,將生命科學(xué)、合成生物學(xué)等理念進(jìn)行宣傳。
從準(zhǔn)備到比賽,學(xué)校本科生院和生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院給予了高度關(guān)注與大力支持。生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院成立了由不同研究領(lǐng)域的老師組成的導(dǎo)師團(tuán)隊(duì)進(jìn)行精心指導(dǎo)。備賽期間,隊(duì)員們進(jìn)行了往期項(xiàng)目調(diào)研、項(xiàng)目選題、軟件功能設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、人文實(shí)踐、算法和建模設(shè)計(jì),克服重重困難斬獲佳績。這是學(xué)校用心培養(yǎng)具有國際競爭力的拔尖創(chuàng)新人才的又一重大成果,更是學(xué)習(xí)貫徹落實(shí)黨的二十大精神,為建設(shè)教育強(qiáng)國、科技強(qiáng)國、人才強(qiáng)國貢獻(xiàn)力量,全面推進(jìn)中華民族偉大復(fù)興的實(shí)際行動。